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Préparation du docking

Sélection d'une molécule médicament connue (par exemple Vemurafenib ou Ibuprofen)

Le docking consiste à prédire la position d'une petite molécule dans une protéine cible. Vous pouvez sélectionner la molécule et la protéine. Pour cela, glissez-déposez l'image de la molécule sur l'image de la protéine.



Dessin d'une nouvelle molécule

Vous avez la possibilité de concevoir votre propre molécule en cliquant sur la boîte "Dessinez votre propre molécule"(1). Un outil permettant de dessiner des molécules apparaît au bas de la page(2). Sélectionner les atomes (à droite), les liaisons (à gauche) et les cycles (en bas) pour construire la structure en 2D de votre molécule. L'utilisation de l'outil de dessin Marvin for JavaScript est décrite en détails ici. Une fois satisfait de votre dessin, cliquer sur le bouton "Fini" pour faire apparaître la molécule dans la boîte "Votre molécule"(3).



Il suffit ensuite de glisser-déposer l'image de la molécule que vous avez dessinée sur l'image de la protéine cible(4).